分子生物学软件应用

　　 第一部分 核酸序列分析
　　1 序列检索与格式转换
　　 1．1序列检索
　　 1．2序列格式简介
　　 1．3格式转换
　　2 一级结构分析
　　 2．1组成成分分析
　　 2．2重复序列
　　 2．3序列变换
　　3 克隆
　　 3．1酶切位点查找
　　 3．2模拟电泳
　　 3．3电泳图像分析
　　 3．4质粒绘图
　　 3．5克隆策略与过程显示
　　4 引物设计
　　 4．1引物设计的基本原则
　　 4．2引物设计与分析
　　 4．3高通量引物与探针设计
　　5 测序拼装
　　 5．1测序图分析
　　 5．2测序拼装
　　6 DNA功能分析
　　 6．1 ORF查找与翻译
　　 6．2 Motif查找
　　7 RNA二级结构预测
　　 7．1 RNAstructure
　　 7．2 RNAdraw
　　 7．3 DNAstar
　　 第二部分 蛋白质序列分析
　　1 理化性质分析
　　 1．1蛋白酶酶切特性
　　 1．2滴定曲线与等电点
　　 1．3亲水性和疏水性
　　 1．4电荷密度
　　2 二级结构预测
　　 2．1 DNAstar
　　 2．2 Vector NTI Advance
　　 2．3 ANTHEPR()T
　　3 其他特殊局部结构分析
　　 3．1膜蛋白的跨膜螺旋
　　 3．2信号肽
　　 3．3卷曲螺旋
　　 3．4抗原决定簇
　　4 三维分子显示
　　 4．1 RasMol
　　 4．2 Vector NTI Advance
　　 4．3 Cn3D
　　 第三部分 序列比对及进化树
　　1 BLAST
　　 1．1 BLAST简介
　　 1．2 BLAST、实践
　　 1．3 BLAST、高级选项
　　2 本地BLAKI
　　3 多序列之间的两两比对与进化树分析
　　 3．1 C1ustalX
　　 3．2 DNAstar
　　 3．3 Vector NTI Advance
　　 3．4 PLYLIP
　　 第四部分 文献管理与引用
　　1 文献管理
　　 1．1 Reference Manager
　　 1．2 EndINote
　　 1．3 NoteExpress
　　 1．4全文查找
　　2 在Word中引用文献
　　 2．1 Reference Manager
　　 2．2 EndNote
　　 2．3 NoteExpress
　　附录1 软件简介
　　附录2 参考文献