Proteins structure and function

　　译者序
　　前言
　　本书使用说明
　　从序列到结果
　　第一章 从序列到结构
　　 1-0 概述：蛋白质的功能和构造
　　 1-1 氨基酸
　　 l-2 基因和蛋白质
　　 1-3 肽键
　　 1-4 稳定折叠蛋白质的键
　　 1-5 二级结构的重要性和决定因素
　　 1-6 α螺旋的特征
　　 1-7 β折叠的特征
　　 1-8 二级结构的预测
　　 1-9 折叠
　　 1-10 三级结构
　　 1-11 膜蛋白的结构
　　 l-12 蛋白质稳定性：弱相互作用和柔韧性
　　 1-13 蛋白质稳定性：翻译后修饰
　　 1-14 蛋白质的域
　　 l-15 蛋白质结构通则
　　 1-16 蛋白质基序
　　 1-17 α域和8域
　　 1-18 α/β、α＋β和交联域
　　 1-19 四级结构：一般原则
　　 l-20 四级结构：分子间界面
　　 l-2l 四级结构：几何学
　　 l-22 蛋白质的柔韧性
　　第二章 从结构到功能
　　 2-0 概述：蛋白质功能的结构基础
　　 2-1 识别、互补和活性位点
　　 2-2 柔韧性和蛋白质功能
　　 2-3 结合位点的位置
　　 2-4 结合位点的性质
　　 2-5 结构蛋白的功能特性
　　 2-6 催化：概述
　　 2-7 活性位点的几何学
　　 2-8 邻近性和基态去稳定
　　 2-9 稳定过渡态和排斥水
　　 2-10 氧还反应
　　 2-11 加成/消除、水解和脱羧
　　 2-12 活性位点的化学
　　 2-13 辅助因子
　　 2-14 多步反应
　　 2-15 多功能酶
　　 2-16 具有通道的多功能酶
　　第三章 蛋白质功能的调控
　　 3-0 概述：调节的机制
　　 3-1 蛋白质相互作用域
　　 3-2 定位调节
　　 3-3 pH和氧化还原环境对蛋白质功能的调控
　　 3-4 效应物配体：竞争性结合与协同效应
　　 3-5 效应物配体：构象变化与别构效应
　　 3-6 基于核苷酸水解反应的蛋白质开关
　　 3-7 GTP酶开关：小信号G蛋白
　　 3-8 GTP酶开关：异源三聚体G蛋白酶转导的信号
　　 3-9 GTP酶开关：蛋白质合成
　　 3-10 马达蛋白开关
　　 3-11 受降解作用的调节
　　 3-12 蛋白质功能的磷酸化调节
　　 3-13 信号蛋白质激酶的调节：激活机制
　　 3-14 信号蛋白质激酶的调节：Cdk的激活
　　 3-15 细菌的双组分信号转导系统
　　 3-16 蛋白酶水解的调控作用：蛋白质前体的激活
　　 3-17 蛋白质剪接：通过内蛋白子自身酶解
　　 3-18 糖基化
　　 3-19 脂质修饰介导的蛋白质靶向
　　 3-20 甲基化、N-乙酰化、SUMO化和亚硝基化
　　第四章 从顺序到功能：结构和功能基因组学中的案例分析
　　 4-0 概述：在基因组学的时代背景下从顺序到功能
　　 4-1 序列对位排列和比较
　　 4-2 蛋白质特征集
　　 4-3 从顺序推测功能
　　 4-4 研究蛋白质功能的实验手段
　　 4-5 趋异进化和趋同进化
　　 4-6 从顺序到结构：同源模建
　　 4-7 从顺序到结构：Profile-based threading方法和“Rosetta”
　　 4-8 从结构预测功能：蛋白质超家族
　　 4-9 确定结合位点的策略
　　 4-10 确定催化残基的策略
　　 4-11 TIM桶：一种结构，多种功能
　　 4-12 PLP酶：多种功能，一种结构
　　 4-13 兼职：多功能蛋白质
　　 4-14 变色龙序列：一条序列，多种折叠方式
　　 4-15 朊病毒、淀粉状蛋白和丝氨酸蛋白酶抑制剂：亚稳定的蛋白质折叠
　　 4-16 从未研究过的基因的功能：半乳糖酸脱水酶
　　 4-17 从零开始：一个功能未知的基因产物
　　第五章 结构测定
　　 5-1 结构信息的解读
　　 5-2 利用X射线晶体分析法和NMR法进行结构测定
　　 5-3 晶体和NMR结构的质量及表述
　　参考文献
　　定义
　　索引