R语言与Bioconductor生物信息学应用
副标题：无
分类号：
ISBN：9787543333604
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简介
国内首部与SCI文章紧密结合的生物信息书籍。大量实际课题来自发表的SCI文章，全部都是“真枪实弹”，不杜撰所谓“实际应用”。
通过前期网上调研，了解并在书中突出大多数读者普遍关心而又难寻相关资料的问题。
从实际课题出发，提出解决问题的思路，结合原理把讲解延伸到具体程序代码。所见即所得，学到的知识可以通过简单编程加以实现。三板斧法学习R语言，让无基础的人也能轻松编程。
目录
第一章R基础知识
1.1什么是R
1.2R的下载与安装
1.3R语言快速入门
1.4一些简单的语法知识
1.5本章源代码详解及小结
第二章生物信息学基础知识
2.1中心法则——生物信息流
2.2测序与序列分析
2.3基因表达分析
2.4注释、统计与可视化
第三章R在生物信息学中的简单应用
3.1一个序列分析课题
3.2用R包（非Bioconductor）实现课题
3.3用R包（Bioconductor）再实现课题（方法一）
3.4用R包（Bioconductor）再实现课题（方法二）
第四章Bioconductor简介
4.1什么是Bioconductor
4.2Bioconductor的分类介绍
4.3从R到Bioconductor的跨越
第五章Bioconductor分析基因芯片数据
5.1快速入门
5.2基因芯片基础知识
5.3基因芯片数据预处理
5.4基因芯片数据分析
5.5芯片处理实际课题一
5.6芯片处理实际课题二
5.7芯片处理实际课题三
第六章Bioconductor分析RNA—seq数据
6.1示例课题介绍
6.2高通量测序基础知识
6.3RNA—seq技术的特点
6.4RNA—seq数据预处理
6.5RNA—seq数据分析
第七章R的高级语法与如何创建R包
7.1R的高级语法
7.2创建及发布自己的R/Bioconductor包
7.3R包结构
附录A进一步学习的资源
附录BR常用函数
附录CR的内存管理和帮助系统
1.1什么是R
1.2R的下载与安装
1.3R语言快速入门
1.4一些简单的语法知识
1.5本章源代码详解及小结
第二章生物信息学基础知识
2.1中心法则——生物信息流
2.2测序与序列分析
2.3基因表达分析
2.4注释、统计与可视化
第三章R在生物信息学中的简单应用
3.1一个序列分析课题
3.2用R包（非Bioconductor）实现课题
3.3用R包（Bioconductor）再实现课题（方法一）
3.4用R包（Bioconductor）再实现课题（方法二）
第四章Bioconductor简介
4.1什么是Bioconductor
4.2Bioconductor的分类介绍
4.3从R到Bioconductor的跨越
第五章Bioconductor分析基因芯片数据
5.1快速入门
5.2基因芯片基础知识
5.3基因芯片数据预处理
5.4基因芯片数据分析
5.5芯片处理实际课题一
5.6芯片处理实际课题二
5.7芯片处理实际课题三
第六章Bioconductor分析RNA—seq数据
6.1示例课题介绍
6.2高通量测序基础知识
6.3RNA—seq技术的特点
6.4RNA—seq数据预处理
6.5RNA—seq数据分析
第七章R的高级语法与如何创建R包
7.1R的高级语法
7.2创建及发布自己的R/Bioconductor包
7.3R包结构
附录A进一步学习的资源
附录BR常用函数
附录CR的内存管理和帮助系统
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