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简介
《科学版研究生教学丛书:化学信息学(第2版)》介绍了计算机与计算机网络的一些基础知识以及如何利用Internet上的化学资源,并对化学信息学在化学、生物化学领域中的应用进行了详细论述。主要内容有计算机与Internet基础、联机文献检索、网络图书与网络杂志、数据库资源、化学信息资源查询、化学信息的计算机管理与应用、化学信息的计算机模拟、多元校正与因子分析、人工神经网络、遗传算法和模拟退火算法、小波分析、免疫算法等。
《科学版研究生教学丛书:化学信息学(第2版)》可供化学、化工、生物化学、药物化学以及相关专业的广大科技工作者和高等院校师生参阅。
目录
第二版前言.
第一版前言
第1章 计算机与internet基础
1.1操作系统
1.1.1unix系统的构成
1.1.2unix系统的登录
1.1.3unix系统的基本命令
1.1.4unix系统的文件属性
1.1.5unix系统的文件编辑器
1.2 计算机语言与程序设计
1.2.1计算机语言
1.2.2matlab语言简介
1.2.3程序设计
1.3 internet基本概念
1.3.1计算机网络和tcp/ip协议
1.3.2internet网际地址
1.3.3域名系统
1.3.4连入internet
1.4 internet服务与利用
1.4.1远程登录
.1.4.2文件传输
1.4.3电子邮件
1.4.4通信讨论组
1.4.5网络新闻
1.4.6www服务
1.4.7internet查询工具
1.5 服务器的建立与主页制作
1.5.1服务器的建立
1.5.2主页制作语言简介
上机训练与习题
第2章 联机文献检索
2.1美国化学文摘
2.1.1美国化学文摘简介
2.1.2美国化学文摘的著录内容与格式
2.1.3caoncd的使用方法
2.2 webofscience
2.2.1webofscience简介
2.2.2webofscience的文献收录内容与格式
2.2.3webofscience的功能与使用方法
2.2.4isiwebofknowledge的其他功能
2.3 eicompendexweb
2.3.1eicompendexweb简介
2.3.2eicompendexweb的功能与使用方法
2.4 期刊全文数据库
2.4.1elseviersdos数据库
2.4.2acs期刊数据库
2.5 国内学术期刊数据库
2.5.1中国期刊网
2.5.2万方数据库
2.6 其他文献检索系统简介
2.7 专利文献查询
上机训练与习题
第3章 网络图书与网络杂志
3.1 网上图书馆
3.1.1图书馆主页
3.1.2www虚拟图书馆
3.2 网上书店
3.3 网络杂志
3.4 数字化图书
3.5 出版商主页
上机训练与习题
第4章 数据库资源
4.1 综合性数据库
4.1.1stn系统
4.1.2dialog系统
4.1.3entrez系统
4.1.4国内数据库资源简介
4.2 化学信息数据库
4.2.1剑桥结构数据库
4.2.2布鲁克海文蛋白质数据库
4.2.3核酸数据库
4.2.4化合物基本性质数据库
4.2.5nist的chemistry webbook
4.2.6化合物谱图数据库
4.3 网上化学手册
4.3.1物理化学常数
4.3.2化学元素周期表
上机训练与习题..
第5章化学信息资源查询
5.1查询与导航
5.2chin简介
5.3商业信息
5.4化学机构信息
上机训练与习题
第6章 化学信息的计算机管理与应用
6.1 化学信息的计算机表示
6.1.1数据信息的计算机处理
6.1.2结构信息的计算机表示
6.1.3化学信息的可视化
6.2 化学信息数据库
6.2.1数据库系统的构成
6.2.2数据模型和数据库的类型
6.2.3数据库的存取过程
6.2.4化学信息数据库
6.3 化学人工智能与专家系统
6.3.1人工智能
6.3.2知识库
6.3.3推理方法
6.3.4专家系统
6.4 计算机辅助结构解析
6.4.1结构解析系统的构成
6.4.2结构解析的工作过程
6.4.3结构解析中的有关技术
6.5 计算机辅助合成设计
6.5.1计算机辅助有机合成
6.5.2计算机辅助分子设计
上机训练与习题
第7章 化学信息的计算机模拟
7.1 nmr波谱模拟
7.1.1质子nmr谱的量子化学模拟
7.1.213c-nmr谱的计算机模拟
7.2 分子模拟
7.2.1分子模拟的基本方法
7.2.2分子力学简介
7.2.3分子模拟应用举例
上机训练与习题
第8章 多元校正与因子分析
8.1 引言
8.1.1化学计量学
8.1.2多元校正与分辨
8.1.3化学因子分析
8.2 数据矩阵的构成
8.2.1二维色谱数据
8.2.2三维荧光光谱数据
8.2.3多组分光度分析数据
8.2.4配合物体系的研究
8.3 间接校正方法
8.3.1k一矩阵法
8.3.2p一矩阵法
8.4 kalman滤波法
8.4.1kalman滤波用于多元校正的原理
8.4.2kalman滤波用于多元校正的计算步骤
8.4.3kalman滤波法的应用实例
8.5 化学因子分析
8.5.1化学因子分析的基本步骤
8.5.2常见的化学因子分析方法
8.6 主成分回归
8.7 偏最小二乘法
上机训练与习题
第9章 人工神经网络
9.1 人工神经网络的基本特征
9.2 人工神经网络的基本模型
9.3 神经元的结构模型
9.4 人工神经网络的学习算法
9.5 人工神经网络的应用
上机训练与习题
第10章 遗传算法和模拟退火算法
10.1 遗传算法
10.1.1自然进化与遗传算法
10.1.2遗传算法的基本过程
10.1.3遗传算法的程序实现
10.1.4遗传算法应用举例
10.1.5遗传算法的发展
10.1.6遗传算法在化学中的应用举例
10.2 模拟退火算法
10.2.1固体退火与模拟退火算法
10.2.2模拟退火算法的基本过程
10.2.3模拟退火算法的控制参数
10.2.4模拟退火算法的发展
10.2.5退火演化算法
10.2.6模拟退火算法的应用举例
上机训练与习题
第11章 小波分析
11.1 小波及小波分析
11.1.1小波的定义
11.1.2傅里叶变换
11.1.3小波变换
11.2小波分析的基本算法
11.2.1多尺度分析
11.2.2多尺度信号分解(mrsd)算法
11.2.3mrsd算法的改进
11.2.4小波包变换
11.3小波分析的程序设计
11.3.1matlab工具箱
11.3.2wavelab简介
11.3.3mrsd算法的程序设计
11.3.4连续小波变换的程序设计
11.3.5小波包分析的程序设计
11.4小波分析的应用
11.4.1数据压缩
11.4.2平滑和滤噪
11.4.3背景扣除与基线矫正
11.4.4近似导数的计算
11.4.5重叠信号解析
11.4.6谱图分辨率的改善
11.4.7小波分析的其他应用
上机训练与习题
第12章 免疫算法
12.1免疫算法的原理
12.2一种用于重叠信号解析的免疫算法
12.3免疫优化算法及其应用
上机训练与习题
主要参考文献...
第一版前言
第1章 计算机与internet基础
1.1操作系统
1.1.1unix系统的构成
1.1.2unix系统的登录
1.1.3unix系统的基本命令
1.1.4unix系统的文件属性
1.1.5unix系统的文件编辑器
1.2 计算机语言与程序设计
1.2.1计算机语言
1.2.2matlab语言简介
1.2.3程序设计
1.3 internet基本概念
1.3.1计算机网络和tcp/ip协议
1.3.2internet网际地址
1.3.3域名系统
1.3.4连入internet
1.4 internet服务与利用
1.4.1远程登录
.1.4.2文件传输
1.4.3电子邮件
1.4.4通信讨论组
1.4.5网络新闻
1.4.6www服务
1.4.7internet查询工具
1.5 服务器的建立与主页制作
1.5.1服务器的建立
1.5.2主页制作语言简介
上机训练与习题
第2章 联机文献检索
2.1美国化学文摘
2.1.1美国化学文摘简介
2.1.2美国化学文摘的著录内容与格式
2.1.3caoncd的使用方法
2.2 webofscience
2.2.1webofscience简介
2.2.2webofscience的文献收录内容与格式
2.2.3webofscience的功能与使用方法
2.2.4isiwebofknowledge的其他功能
2.3 eicompendexweb
2.3.1eicompendexweb简介
2.3.2eicompendexweb的功能与使用方法
2.4 期刊全文数据库
2.4.1elseviersdos数据库
2.4.2acs期刊数据库
2.5 国内学术期刊数据库
2.5.1中国期刊网
2.5.2万方数据库
2.6 其他文献检索系统简介
2.7 专利文献查询
上机训练与习题
第3章 网络图书与网络杂志
3.1 网上图书馆
3.1.1图书馆主页
3.1.2www虚拟图书馆
3.2 网上书店
3.3 网络杂志
3.4 数字化图书
3.5 出版商主页
上机训练与习题
第4章 数据库资源
4.1 综合性数据库
4.1.1stn系统
4.1.2dialog系统
4.1.3entrez系统
4.1.4国内数据库资源简介
4.2 化学信息数据库
4.2.1剑桥结构数据库
4.2.2布鲁克海文蛋白质数据库
4.2.3核酸数据库
4.2.4化合物基本性质数据库
4.2.5nist的chemistry webbook
4.2.6化合物谱图数据库
4.3 网上化学手册
4.3.1物理化学常数
4.3.2化学元素周期表
上机训练与习题..
第5章化学信息资源查询
5.1查询与导航
5.2chin简介
5.3商业信息
5.4化学机构信息
上机训练与习题
第6章 化学信息的计算机管理与应用
6.1 化学信息的计算机表示
6.1.1数据信息的计算机处理
6.1.2结构信息的计算机表示
6.1.3化学信息的可视化
6.2 化学信息数据库
6.2.1数据库系统的构成
6.2.2数据模型和数据库的类型
6.2.3数据库的存取过程
6.2.4化学信息数据库
6.3 化学人工智能与专家系统
6.3.1人工智能
6.3.2知识库
6.3.3推理方法
6.3.4专家系统
6.4 计算机辅助结构解析
6.4.1结构解析系统的构成
6.4.2结构解析的工作过程
6.4.3结构解析中的有关技术
6.5 计算机辅助合成设计
6.5.1计算机辅助有机合成
6.5.2计算机辅助分子设计
上机训练与习题
第7章 化学信息的计算机模拟
7.1 nmr波谱模拟
7.1.1质子nmr谱的量子化学模拟
7.1.213c-nmr谱的计算机模拟
7.2 分子模拟
7.2.1分子模拟的基本方法
7.2.2分子力学简介
7.2.3分子模拟应用举例
上机训练与习题
第8章 多元校正与因子分析
8.1 引言
8.1.1化学计量学
8.1.2多元校正与分辨
8.1.3化学因子分析
8.2 数据矩阵的构成
8.2.1二维色谱数据
8.2.2三维荧光光谱数据
8.2.3多组分光度分析数据
8.2.4配合物体系的研究
8.3 间接校正方法
8.3.1k一矩阵法
8.3.2p一矩阵法
8.4 kalman滤波法
8.4.1kalman滤波用于多元校正的原理
8.4.2kalman滤波用于多元校正的计算步骤
8.4.3kalman滤波法的应用实例
8.5 化学因子分析
8.5.1化学因子分析的基本步骤
8.5.2常见的化学因子分析方法
8.6 主成分回归
8.7 偏最小二乘法
上机训练与习题
第9章 人工神经网络
9.1 人工神经网络的基本特征
9.2 人工神经网络的基本模型
9.3 神经元的结构模型
9.4 人工神经网络的学习算法
9.5 人工神经网络的应用
上机训练与习题
第10章 遗传算法和模拟退火算法
10.1 遗传算法
10.1.1自然进化与遗传算法
10.1.2遗传算法的基本过程
10.1.3遗传算法的程序实现
10.1.4遗传算法应用举例
10.1.5遗传算法的发展
10.1.6遗传算法在化学中的应用举例
10.2 模拟退火算法
10.2.1固体退火与模拟退火算法
10.2.2模拟退火算法的基本过程
10.2.3模拟退火算法的控制参数
10.2.4模拟退火算法的发展
10.2.5退火演化算法
10.2.6模拟退火算法的应用举例
上机训练与习题
第11章 小波分析
11.1 小波及小波分析
11.1.1小波的定义
11.1.2傅里叶变换
11.1.3小波变换
11.2小波分析的基本算法
11.2.1多尺度分析
11.2.2多尺度信号分解(mrsd)算法
11.2.3mrsd算法的改进
11.2.4小波包变换
11.3小波分析的程序设计
11.3.1matlab工具箱
11.3.2wavelab简介
11.3.3mrsd算法的程序设计
11.3.4连续小波变换的程序设计
11.3.5小波包分析的程序设计
11.4小波分析的应用
11.4.1数据压缩
11.4.2平滑和滤噪
11.4.3背景扣除与基线矫正
11.4.4近似导数的计算
11.4.5重叠信号解析
11.4.6谱图分辨率的改善
11.4.7小波分析的其他应用
上机训练与习题
第12章 免疫算法
12.1免疫算法的原理
12.2一种用于重叠信号解析的免疫算法
12.3免疫优化算法及其应用
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主要参考文献...
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