希金斯炭疽菌G蛋白信号途径绘制及相关蛋白生物信息学分析

前言

第一章 希金斯炭疽菌的研究进展

一、经济危害及分布情况

(一)经济危害情况

(二)分布情况

二、形态特征及分类地位

(一)形态特征

(二)分类地位

三、生活史及侵染过程

四、遗传关系

五、防治措施

第二章 G蛋白信号途径相关蛋白介绍

一、GPCR

二、Gα、Gβ、Gγ以及PhiPS

(一)Gα、Gβ、Gγ

2.Gβ

3.Gγ

(二)PhLPS

三、调控蛋白RGS

四、G蛋白信号下游效应分子

(一)cAMP—PKA途径

1.AC

2.PKA—R及PKA—C

3.PDE

(二)MAPK途径

1.MAPKKK

2.MAPKK

3 MAPK

(三)IP3-Ca2／DAG—PKC途径

1.PI—PLC

2.PKC

第三章 希金斯炭疽菌G蛋白信号途径图绘制

一、G蛋白信号途径图绘制

(一)C蛋白信号途径相关蛋白获取

1.GPCR获取

2.Gα、Gβ、Gγ以及PhLPS获取

3.RGS获取

4.AC获取

5.PKA—R以及PKA—C获取

6.PDE获取

7.MAPK获取

8.PI—PLC获取

9.PKC获取

(二)G蛋白信号途径绘制

二、问题

三、展望

第四章 希金斯炭疽菌GPCR生物信息学分析

一、GPCR保守结构域分析

二、GPCR理化性质分析

三、GPCR疏水性分析

四、GPCR信号肽、转运肽分析

五、GPCR亚细胞定位分析

六、GPCR二级结构分析

七、GPCR遗传关系分析

第五章 希金斯炭疽菌Gα、Gβ、Gγ生物信息学分析

一、Gα、Gβ、Gγ保守结构域分析

二、Gα、Gβ、Gγ理化性质分析

三、Gα、Gβ、Gγ疏水性分析

四、Gα、Gβ、Gγ信号肽、转运肽分析

五、Gα、Gβ、Gγ亚细胞定位分析

六、Gα、Gβ、Gγ二级结构分析

七、Gα、Gβ、Gγ遗传关系分析

第六章 希金斯炭疽菌PhLPS生物信息学分析

一、PhLPS保守结构域分析

二、PhLPS理化性质分析

三、PhLPS疏水性分析

四、PhLPS信号肽、转运肽分析

五、PhLPS亚细胞定位分析

六、PhLPS二级结构分析

七、PhLPS遗传关系分析

第七章 希金斯炭疽菌RGS生物信息学分析

一、RGS保守结构域分析

二、RGS理化性质分析

三、RGS疏水性分析

四、RGS信号肽、转运肽分析

五、RGS亚细胞定位分析

六、RGS二级结构分析

七、RGS遗传关系分析

第八章 希金斯炭疽菌AC生物信息学分析

一、AC保守结构域分析

二、AC理化性质分析

三、AC疏水性分析

四、AC信号肽、转运肽分析

五、AC亚细胞定位分析

六、AC二级结构分析

七、AC遗传关系分析

第九章 希金斯炭疽菌PKA—R以及PKA—C生物信息学分析

一、PKA—R以及PKA—C保守结构域分析

二、PKA—R以及PKA—C理化性质分析

三、PKA—R以及PKA—C疏水性分析

四、PKA—R以及PKA—C信号肽、转运肽分析

五、PKA—R以及PKA—C亚细胞定位分析

六、PKA—R以及PKA—C二级结构分析

七、PKA—R以及PKA—C遗传关系分析

第十章 希金斯炭疽菌PDE生物信息学分析

一、PDE保守结构域分析

二、PDE理化性质分析

三、PDE疏水性分析

四、PDE信号肽、转运肽分析

五、PDE亚细胞定位分析

六、PDE二级结构分析

七、PDE遗传关系分析

第十一章 希金斯炭疽菌MAPK信号通路上蛋白生物信息学分析

一、MAPK信号通路上蛋白保守结构域分析

二、MAPK信号通路上蛋白理化性质分析

三、MAPK信号通路上蛋白疏水性分析

四、MAPK信号通路上蛋白信号肽、转运肽分析

五、MAPK信号通路上蛋白亚细胞定位分析

六、MAPK信号通路上蛋白二级结构分析

七、MAPK信号通路上蛋白遗传关系分析

第十二章 希金斯炭疽菌PI—PLC生物信息学分析

一、PI—PLC保守结构域分析

二、PI—PLC理化性质分析

三、PI—PLC疏水性分析

四、PI—PLC信号肽、转运肽分析

五、PI—PLC亚细胞定位分析

六、PI—PLC二级结构分析

七、PI—PLC遗传关系分析

第十三章 希金斯炭疽菌PKC生物信息学分析

一、PKC保守结构域分析

二、PKC理化性质分析

三、PKC疏水性分析

四、PKC信号肽、转运肽分析

五、PKC亚细胞定位分析

六、PKC二级结构分析

七、PKC遗传关系分析

参考文献

附录

附录1 希金斯炭疽菌PKA—C BLASTP比对结果

附录2 希金斯炭疽菌PKCBLASTP比对结果

附录3 希金斯炭疽茵G蛋白亚基遗传关系分析结果

致谢