Study of intelligent computing theory and methodology in bioinformatics

第一部分　蛋白质结构与相互作用
Structural Modelling of the Saccharomyces Cerevisiae and Candida Albicans PEPCKs:Models for the Antifungal Drug Design&Zhen Qian,Liang Shan,Beibei Niu,Feng Wang,Shengrong Tang,Bin Xu,Juhong Tao,Hui Dong,Shuangxi Ren
计算机模拟短小芽孢杆菌木聚糖酶与底物木聚糖的对接&林锦霞，张燎原，张光亚，方柏山
数据挖掘在蛋白质二级结构建模中的应用研究&刘满强，周承刚，周红莉　
一种基于最小自由能和协变信息预测带伪结RNA二级结构的迭代化方法&王金华，骆志刚，管乃洋，严繁妹，靳新，张雯　
Effective Protein Folding Prediction Based on Genetic-Annealing Algorithm in Toy Model&Xiaolong Zhang,Xiaoli Lin
3D Structural Motif Finding in Protein Strutures by Network Alignment&Yong Wang,Zhenping Li,Xiangsun Zhang,Luonan Chen　
RelBay:A Combined Method for Mining Literature of Protein Phosphorylation Sites&Lirong Wang,Wenlong Xu,Xie Dan,Huanqing Feng,Zhaohui Jiang　
Prediction of Enzyme Catalytic Residues Based on Naive Bayes Classification&Yun Xu,Kunpeng Zhang,Guoliang Chen　
蛋白质折叠速率计算&马彬广　
第二部分　基因测定与算法设计
Mining Data of Global Gene Expression in Human Skeletal Muscle Relate to Regular Aerobic Exercise by BRB-ArrayTools&Ke Jiebing,Ma Wenli,Lin Jiandi,Jiang Li,Zheng Wenling　
酵母基因上游中二聚体寡核苷酸转录调控位点的分析&王秀荷，张静，胡俊　
基于基因表达谱的肿瘤分类研究进展&王树林，陈火旺，王戟　
基于大规模DNA微阵列数据的调控亚网络的重建&陈晓辉，宁开达，陈铭　
基于模糊关联规则的聚类算法在基因表达数据分析中的研究&徐旭东，郑欣　
基于序列特征的戊肝病毒基因分型方法&刘志华，董晨，孟继鸿，孙啸　
细菌基因组水平转移基因预测&吴建盛，李菊荣，周豪彦，周童，翁建洪，孙啸　
Quantitative Analysis of Gene Regulatory Networks in Response to Various Environmental Stresses&Ting Chen,Feng Li,Bor-Sen Chen,Liang Chen　
调控元件和组合元件的识别以及全基因组分布分析&黄甲平，韦芬霞，吴建盛，孙啸　
Hybrid Intelligent Data Mining Techniques and Array CGH in Breast Cancer Profiling&Filippo Menolascina,Stefania Tommasi,Vita Fedele,Angelo Paradiso,Giuseppe Mastronardi,Vitoantonio Bevilacqua　
基于基因芯片表达谱的癌症预后元分析研究&杨锡南，孙啸　
针对早期应答基因的专用检测芯片设计&肖强海，Saleh,Hatem Mohamed，马维骏　
第三部分　序列分析与结构比对
一种快速的序列次序无关的结构比对方法&项俊平，胡茂林　
A New Method for Pairwise Protein Structure Alignment&Yuefeng Shen,Bo Li　
Genome-wide Comparative Phylogenetic Analysis of SBP-box Gene Family in Arabidopsis and Rice&Zefeng Yang,Xuefeng Wang,Shiliang Gu,Zhiqiu Hu,Hua Xu,Chenwu Xu　
第四部分　生物数据库的开发、管理与搜索策略
生物序列数据库管理系统研究&熊赟，张锐，陈越，朱扬勇
基于Web的基因表达数据管理系统的设计与实现&徐旭东，韩丹，郑欣，刘国明　
疾病相关SNP数据的分类组织及数据库构建&张青青，王琦，赵嫒嫒，吴建盛，陆祖宏，孙啸　
MoBIoS Index:Support Distance-Based Queries in Bioinformatics&Rui Mao,Weijia Xu,Willard S.Willard,Smriti R.Ramakrishnan,Daniel P.Miranker　
第五部分　智能计算在生物信息学领域的应用研究
SAT问题的主要算法模型&刘伟，孙守霞　
拟位生物信息学分析工具&黄健，张安英　
A New Method for Conversion from Torsion Space to Cartesian Space&Banghe Li,Yuefeng Shen　
Thirty-four Pseudoknots of Twenty-two Human C2H2 Zinc Finger ESTs Discovered by Computational Structural Analysis&Shaowu Meng,Zhuo Zhang,Zhong Yang　
An Adaptive Elastic Registration of Two-Dimensional Electrophoresis Gel Images Using Intensity Information and Landmark Points&Shicai Fan,Lijiang Wu,Xuegong Zhang
具有灾变效应的合作式协同进化遗传算法&程俊，顾幸生　
Data Model of Knowledge Base of Reproductive Biology&Chunsheng Han,Shaoyuan Yao,Xiongying Yuan　
Effect of Decay Functions in Medical Diagnoses with GRLS Neural Networks&Yong Xu,Kwok-Wo Wong,　
第六部分　其他
Bcl-2家族蛋白调控线粒体外膜通透性的细胞自动机模拟&陈春，崔隽，张帅，沈萍萍　
The Relationship Between Molecular Motions of HIV-1 gp120 Mutants and Their Preferences for Different Conformations&Shuqun Liu,Shixi Liu,Ciqun Liu,Yunxin Fu　
Neighboring Nucleotide Biases of the Intra-Varietal Single Nucleotide Polymorphisms of the rice Plastid Genome&Xiangjun Tian,Songnian Hu,JunYu　
基于MATLAB的分子系统学研究——以鳄类分子系统学研究为例&左先波，吴孝兵　
第一部分　蛋白质结构与相互作用
Structural Modelling of the Saccharomyces Cerevisiae and Candida Albicans PEPCKs:Models for the Antifungal Drug Design&Zhen Qian,Liang Shan,Beibei Niu,Feng Wang,Shengrong Tang,Bin Xu,Juhong Tao,Hui Dong,Shuangxi Ren
计算机模拟短小芽孢杆菌木聚糖酶与底物木聚糖的对接&林锦霞，张燎原，张光亚，方柏山
数据挖掘在蛋白质二级结构建模中的应用研究&刘满强，周承刚，周红莉　
一种基于最小自由能和协变信息预测带伪结RNA二级结构的迭代化方法&王金华，骆志刚，管乃洋，严繁妹，靳新，张雯　
Effective Protein Folding Prediction Based on Genetic-Annealing Algorithm in Toy Model&Xiaolong Zhang,Xiaoli Lin
3D Structural Motif Finding in Protein Strutures by Network Alignment&Yong Wang,Zhenping Li,Xiangsun Zhang,Luonan Chen　
RelBay:A Combined Method for Mining Literature of Protein Phosphorylation Sites&Lirong Wang,Wenlong Xu,Xie Dan,Huanqing Feng,Zhaohui Jiang　
Prediction of Enzyme Catalytic Residues Based on Naive Bayes Classification&Yun Xu,Kunpeng Zhang,Guoliang Chen　
蛋白质折叠速率计算&马彬广　
第二部分　基因测定与算法设计
Mining Data of Global Gene Expression in Human Skeletal Muscle Relate to Regular Aerobic Exercise by BRB-ArrayTools&Ke Jiebing,Ma Wenli,Lin Jiandi,Jiang Li,Zheng Wenling　
酵母基因上游中二聚体寡核苷酸转录调控位点的分析&王秀荷，张静，胡俊　
基于基因表达谱的肿瘤分类研究进展&王树林，陈火旺，王戟　
基于大规模DNA微阵列数据的调控亚网络的重建&陈晓辉，宁开达，陈铭　
基于模糊关联规则的聚类算法在基因表达数据分析中的研究&徐旭东，郑欣　
基于序列特征的戊肝病毒基因分型方法&刘志华，董晨，孟继鸿，孙啸　
细菌基因组水平转移基因预测&吴建盛，李菊荣，周豪彦，周童，翁建洪，孙啸　
Quantitative Analysis of Gene Regulatory Networks in Response to Various Environmental Stresses&Ting Chen,Feng Li,Bor-Sen Chen,Liang Chen　
调控元件和组合元件的识别以及全基因组分布分析&黄甲平，韦芬霞，吴建盛，孙啸　
Hybrid Intelligent Data Mining Techniques and Array CGH in Breast Cancer Profiling&Filippo Menolascina,Stefania Tommasi,Vita Fedele,Angelo Paradiso,Giuseppe Mastronardi,Vitoantonio Bevilacqua　
基于基因芯片表达谱的癌症预后元分析研究&杨锡南，孙啸　
针对早期应答基因的专用检测芯片设计&肖强海，Saleh,Hatem Mohamed，马维骏　
第三部分　序列分析与结构比对
一种快速的序列次序无关的结构比对方法&项俊平，胡茂林　
A New Method for Pairwise Protein Structure Alignment&Yuefeng Shen,Bo Li　
Genome-wide Comparative Phylogenetic Analysis of SBP-box Gene Family in Arabidopsis and Rice&Zefeng Yang,Xuefeng Wang,Shiliang Gu,Zhiqiu Hu,Hua Xu,Chenwu Xu　
第四部分　生物数据库的开发、管理与搜索策略
生物序列数据库管理系统研究&熊赟，张锐，陈越，朱扬勇
基于Web的基因表达数据管理系统的设计与实现&徐旭东，韩丹，郑欣，刘国明　
疾病相关SNP数据的分类组织及数据库构建&张青青，王琦，赵嫒嫒，吴建盛，陆祖宏，孙啸　
MoBIoS Index:Support Distance-Based Queries in Bioinformatics&Rui Mao,Weijia Xu,Willard S.Willard,Smriti R.Ramakrishnan,Daniel P.Miranker　
第五部分　智能计算在生物信息学领域的应用研究
SAT问题的主要算法模型&刘伟，孙守霞　
拟位生物信息学分析工具&黄健，张安英　
A New Method for Conversion from Torsion Space to Cartesian Space&Banghe Li,Yuefeng Shen　
Thirty-four Pseudoknots of Twenty-two Human C2H2 Zinc Finger ESTs Discovered by Computational Structural Analysis&Shaowu Meng,Zhuo Zhang,Zhong Yang　
An Adaptive Elastic Registration of Two-Dimensional Electrophoresis Gel Images Using Intensity Information and Landmark Points&Shicai Fan,Lijiang Wu,Xuegong Zhang
具有灾变效应的合作式协同进化遗传算法&程俊，顾幸生　
Data Model of Knowledge Base of Reproductive Biology&Chunsheng Han,Shaoyuan Yao,Xiongying Yuan　
Effect of Decay Functions in Medical Diagnoses with GRLS Neural Networks&Yong Xu,Kwok-Wo Wong,　
第六部分　其他
Bcl-2家族蛋白调控线粒体外膜通透性的细胞自动机模拟&陈春，崔隽，张帅，沈萍萍　
The Relationship Between Molecular Motions of HIV-1 gp120 Mutants and Their Preferences for Different Conformations&Shuqun Liu,Shixi Liu,Ciqun Liu,Yunxin Fu　
Neighboring Nucleotide Biases of the Intra-Varietal Single Nucleotide Polymorphisms of the rice Plastid Genome&Xiangjun Tian,Songnian Hu,JunYu　
基于MATLAB的分子系统学研究——以鳄类分子系统学研究为例&左先波，吴孝兵