生物信息学理论与技术

第一章　生物信息数据库
　第一节　核酸序列数据库
　第二节　蛋白质序列数据库
　第三节　基因组数据库
　第四节　结构数据库
　第五节　项数据库
第二章　网络构建
　第一节　Cytoscape简介
　第二节　Cytoscape的安装
　第三节　创建网络
　第四节　Cytoscape插件的应用
　第五节　可视化工具GeneMANIA
第三章　幼年与老年快速老化小鼠海马中差异表达基因谱分析
第四章　成年与老年快速老化小鼠海马中差异表达基因谱分析
第五章　miRNA相关研究
　第一节　miRNA简介及miRNA检测
　第二节　miRNA靶基因预测
　第三节　基于生物信息学的miRNA靶基因功能分析
第六章　大鼠脊髓蛋白组生物信息学分析
第七章　LncRNA数据生物信息学分析
　第一节　LncRNA的定义及来源
　第二节　LncRNA相关信息查找
　第三节　大鼠LncRNA全序列查找
第八章　DNA甲基化检测
　第一节　DNA甲基化概述
　第二节　DNA甲基化的预测
　第三节　MeDIPPCR检测eif5a基因在脊髓损伤大鼠腓肠肌的DNA甲基化改变
第九章　如何从已知靶基因预测与其相互作用的miRNAs
　第一节　用TargetScan预测调控BDNFmRNA的miRNAs
　第二节　用miRanda预测调控BDNFmRNA的miRNAs
　第三节　用miRDB预测调控BDNFmRNA的miRNAs
　第四节　用miRwalk预测调控BDNFmRNA的miRNAs
　第五节　根据需要建立各网站预测结果交集
　第六节　预测中需要注意的问题
第十章　染色质免疫共沉淀技术
　第一节　ChIP技术现状背景及实验原理
　第二节　ChIP实验后续技术
第十一章　生物信息学预测蛋白质相互作用
　第一节　常用的蛋白质相互作用及信号传导相关数据库
　第二节　常用的蛋白质相互作用可视化工具
　第三节　常用的蛋白质序列数据库
　第四节　蛋白质功能、结构域和蛋白质家族有关的数据库
第十二章　利用生物信息学设计PCR引物及探针
　第一节　聚合酶链反应和荧光定量聚合酶链反应的原理与方法
　第二节　引物探针设计的生物信息学