DNA-protein interactions:principles and protocols

前言
撰稿人
1.滤膜结合分析法
2.用凝胶迁移滞后实验(EMSA)分析DNA-蛋白质相互作用
3.DNase Ⅰ足迹法
4.在固定的DNA模板上的外切核酸酶Ⅲ足迹法
5.检测蛋白质-DNA复合物的氢氧自由基足迹法
6.利用焦碳酸二乙酯(DEPC)和高锰酸钾检测DNA的双链分离和结构畸变
7.铀基足迹法
8.用硫酸二甲酯鉴定蛋白质／DNA的结合位点：甲基化保护和甲基化干扰
9.DNA-蛋白质复合物的乙基干扰足迹法
10.用蛋白质-Fe(Ⅱ)EDTA接合体在模型染色质复合物内实现DNA的定点切割
11.用指数富集的配基系统进化技术(SELEX)鉴定蛋白质的核酸高亲度结合序列
12.用Southwestern印迹法鉴定序列特异性DNA结合蛋白
13.用基于1，10-邻二氮杂菲一铜的化学溶核活性的非变性聚丙烯酰胺凝胶检测DNA-蛋白质相互作用
14.用基于核酸酶保护足迹法的Southwestern印迹法测定转录因子结合位点
15.用酵母中的报告基因检测法进行DNA-蛋白质相互作用的遗传分析
16.哺乳动物细胞内的染色体免疫共沉淀
17.连续的染色体免疫共沉淀法：ChIP-reChIP
18.在酿酒酵母中用基于Tiling微阵列的ChIP-chip进行全基因组组蛋白修饰和变异谱分析
19.核小体定位图
20.活体细胞内DNA分析(LMPCR足迹法)
21.原子力显微镜显像技术及其在探测DNA，蛋白质和蛋白质-DNA复合物上的应用：毒鼠硅表面化学
22.可溶蛋白质复合物的二维结晶法
23.转录因子活性的检测方法
24.基于8-叠氮腺苷的蛋白质-DNA复合物紫外光交联
25.用静态和动态的位点特异性的蛋白质-DNA光交联分析细菌的转录起始复合物
26.用位点特异性的蛋白质一DNA光交联对纯化的复合物分析RNA聚合酶Ⅱ转录起始复合物的拓扑结构
27.对多亚基的大蛋白质-DNA复合物进行定点DNA交联
28.用荧光共振能量转移(FRET)进行I)NA-蛋白质相互作用的功能性分析
29.蛋白质-DNA复合物的单分子荧光共振能量转移(FRET)分析
30.分析DNA-蛋白质相互作用诱导的DNA超螺旋
31.用十字型DNA迁移率检测法研究能识别弯曲DNA的蛋白质
32.用质粒载体分析蛋白质诱导的DNA弯曲
33.体外分析特定染色质模板的远程通信
34.用ANS荧光探针检测DNA的竞争性结合
35.用荧光光谱和各向异性分析DNA-蛋白质相互作用
36.用圆二色谱分析蛋白质-DNA相互作用
37.用微热量测量法检测蛋白质-DNA复合物及其组分的热力学特征
38.DNA-蛋白质相互作用的表面等离子体共振检测