Organic chemistry of biological pathways

《现代化学基础丛书》序

作者简介

评阅者及学生评阅者

序

前言

译者的话

第1章生物化学中的基本反应机理

1.1生物化学中的官能团

1.2酸和碱亲电试剂和亲核试剂

布伦斯台德—洛里酸碱

路易斯酸碱

亲电试剂和亲核试剂

1.3亲电加成反应机理

1.4亲核取代反应机理

1.5羰基亲核加成反应机理

亲核加成

醇的生成

亚胺(席夫碱)的生成

缩醛化

共轭(1，4)亲核加成

.1.6酰基亲核取代反应机理

1.7羰基缩合反应机理

1.8消去反应机理

1.9氧化和还原反应

习题

第2章生物分子

2.1手性和生物化学

对映体

非对映异构体，差向异构体和内消旋化合物

前手性

2.2生物分子：脂质

三酰甘油

其他脂质：类萜、类固醇和前列腺素

2.3生物分子：碳水化合物

碳水化合物的立体化学

单糖异头物

二糖和多糖

脱氧糖和氨基糖

2.4生物分子：氨基酸、肽和蛋白质

氨基酸

肽和蛋白质

2.5生物分子：核酸

dna：脱氧核糖核酸

rna：核糖核酸

2.6生物分子：酶、辅酶以及串联反应

酶

辅酶

串联反应和高能化合物

习题

第3章脂质代谢

3.1三酰甘油的消化与转移

三酰甘油的水解

可视化酶结构的简要描述

三酰甘油的再合成

3.2三酰甘油的分解代谢：甘油的去向

3.3三酰甘油的分解代谢：脂肪酸的氧化

3.4脂肪酸的生物合成

3.5萜类化合物的合成

甲羟戊酸途径到异戊烯基二磷酸

由脱氧木酮糖磷酸到异戊烯基二磷酸

异戊烯基二磷酸到萜类化合物的转化

3.6类固醇的生物合成

法呢基二磷酸到角鲨烯的转化

角鲨烯到羊毛甾醇的转化

参考文献

习题

第4章碳水化合物代谢

4.1复杂碳水化合物的消化与水解

4.2葡萄糖的分解代谢：糖酵解

4.3丙酮酸转化

将丙酮酸转化为乳酸

将丙酮酸转化为乙醇

将丙酮酸转化为乙酰辅酶a

4.4柠檬酸循环

4.5葡萄糖的生物合成：糖异生作用

4.6戊糖磷酸代谢途径

4.7光合作用：戊糖磷酸的还原循环

参考文献

习题

第5章氨基酸代谢

5.1氨基酸的脱氨化

氨基酸的转氨化

谷氨酸的氧化脱氨

5.2尿素循环

5.3氨基酸碳链的分解代谢

丙氨酸、丝氨酸、甘氨酸、半胱氨酸、苏氨酸和色氨酸

关于含铁络合物氧化态的简要概述

关于plp反应的简要描述

天冬酰胺与天冬氨酸

谷氨酰胺、谷氨酸、精氨酸、组氨酸与脯氨酸

缬氨酸、异亮氨酸与亮氨酸

甲硫氨酸

赖氨酸

苯丙氨酸与酪氨酸

5.4非必需氨基酸的生物合成

丙氨酸、天冬氨酸、谷氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、精氨酸与脯氨酸

丝氨酸、半胱氨酸与甘氨酸

5.5必需氨基酸的生物合成

赖氨酸、甲硫氨酸与苏氨酸

异亮氨酸、缬氨酸与亮氨酸

色氨酸、苯丙氨酸与酪氨酸

组氨酸

参考文献

习题

第6章核苷酸代谢

6.1核苷酸分解代谢

嘧啶：胞苷、尿苷和胸苷

嘌呤：腺苷和鸟苷

6.2嘧啶核糖核苷酸的生物合成

尿苷单磷酸

胞苷三磷酸

6.3嘌呤核苷酸的生物合成

肌苷酸

腺苷单磷酸和鸟苷单磷酸

6.4脱氧核糖核苷酸的生物合成

脱氧腺苷、脱氧鸟苷、脱氧胞苷和脱氧尿苷二磷酸

胸苷单磷酸

参考文献

习题

第7章一些天然产物的生物合成

7.1青霉素与头孢菌素的生物合成

青霉素

异青霉素n

头孢菌素

7.2吗啡的生物合成

7.3前列腺素和其他类二十烷酸的生物合成

7.4红霉素的生物合成

7.5辅酶b12和其他四吡咯化合物的生物合成

尿卟啉原ⅲ

血红素

辅酶维生素b12

参考文献

习题

第8章生物化学转化总揽

水解，酯化，硫酯化及酰胺化反应

羰基缩合反应

羧化和脱羧反应

氨化和脱氨化反应

c1转移反应

重排应

异构化和差向异构化反应

羰基化合物的氧化与还原反应

通过金属配合物的羟基化反应和其他氧化反应

附录a

使用swiss pdb浏览器观察蛋白质分子

下载pdb坐标文件

下载swiss db浏览器

分离乙醇脱氢酶的活性中心

进一步研究乙醇脱氢酶的活性中心

习题

附录b

kegg和brenda数据库

附录c

每章习题答案

附录d

英文名缩写、全称及其中文名对照表