等位基因频率资料分支分类方法及模拟研究

前言
1 引言
2 重构系统发育的分析方法
2.1 数量分类学方法
2.1.1 相似性系数
2.1.2 数量分类方法
2.2 分支分类学方法
2.2.1 俭约分支分类方法
2.2.2 统计分支分类方法
2.3 分支分类方法的有效性研究
2.3.1 分支分类方法的稳定性分析
2.3.2 模拟研究
3 分支分类新方法的理论基础
3.1 群体遗传分化与系统发育信息
3.1.1 系统发育信息的产生和变异
3.1.2 系统发育信息的保存
3.1.3 系统发育信息的传递
3.2 等位基因频率性状状态划分
3.3 等位基因频率资料重构系统发育的几个基本原理
4 等位基因频率资料的分支分类新方法
4.1 分支分析的基本过程
4.2 几个问题的探讨
4.2.1 等位基因频率的质量性状和数量性状
4.2.2 在等位基因频率空间重构系统发育关系
4.2.3 祖先类群位点平均杂合性
4.2.4 一些具体过程的处理差异
4.3 等位基因频率资料的分支分类方法的程序化
5 分支分类新方法有效性的模拟研究
5.1 系统发育关系(真树)的构建
5.2 专题研究：几个因子对系统发育重构的影响
5.3 系统发育重构中真树识别
5.4 模拟研究结果概述
5.5 模拟研究结果的方差分析
5.5.1 单因素方差分析
5.5.2 多因素方差分析
5.6 专题研究：几个重要因素对真树求解能力的影响
5.6.1 平行进化与系统发育分析的关系
5.6.2 逆转现象与真树求解能力的关系
5.6.3 灭绝现象与系统发育分析效率的关系
5.6.4 成种事件等位基因突变数和真树求解能力的关系
6 总结
参考文献
前言
1 引言
2 重构系统发育的分析方法
2.1 数量分类学方法
2.1.1 相似性系数
2.1.2 数量分类方法
2.2 分支分类学方法
2.2.1 俭约分支分类方法
2.2.2 统计分支分类方法
2.3 分支分类方法的有效性研究
2.3.1 分支分类方法的稳定性分析
2.3.2 模拟研究
3 分支分类新方法的理论基础
3.1 群体遗传分化与系统发育信息
3.1.1 系统发育信息的产生和变异
3.1.2 系统发育信息的保存
3.1.3 系统发育信息的传递
3.2 等位基因频率性状状态划分
3.3 等位基因频率资料重构系统发育的几个基本原理
4 等位基因频率资料的分支分类新方法
4.1 分支分析的基本过程
4.2 几个问题的探讨
4.2.1 等位基因频率的质量性状和数量性状
4.2.2 在等位基因频率空间重构系统发育关系
4.2.3 祖先类群位点平均杂合性
4.2.4 一些具体过程的处理差异
4.3 等位基因频率资料的分支分类方法的程序化
5 分支分类新方法有效性的模拟研究
5.1 系统发育关系(真树)的构建
5.2 专题研究：几个因子对系统发育重构的影响
5.3 系统发育重构中真树识别
5.4 模拟研究结果概述
5.5 模拟研究结果的方差分析
5.5.1 单因素方差分析
5.5.2 多因素方差分析
5.6 专题研究：几个重要因素对真树求解能力的影响
5.6.1 平行进化与系统发育分析的关系
5.6.2 逆转现象与真树求解能力的关系
5.6.3 灭绝现象与系统发育分析效率的关系
5.6.4 成种事件等位基因突变数和真树求解能力的关系
6 总结
参考文献