Environmental and ecological statistics with R

《环境与生态统计―r语言的应用》

表清单

图清单

第1部分基本概念

第1章引言

1.1美国佛罗里达everglades湿地案例

1.2统计学问题

1.3参考文献说明

第2章r语言

2.1什么是r语言?

2.2开始使用r语言

2.2.1r提示符与赋值

2.2.2数据类型

2,2.3r的函数

2.3rcommander

第3章统计假设

3.1正态性假设

3.2独立性假设

3.3等方差假设

3.4探索性数据分析

.3.4.1展示分布的图形

3.4.2比较分布的图形

3.4.3识别变量问依存关系的图形

3.5从图形到统计学思维

3.6参考文献说明

第4章统计推断

4.1总体均值和置信区间的估计

4.1.1估计标准误的自举法

4.2假设检验

4.2.1t检验

4.2.2双侧备择

4.2.3用置信区间进行假设检验

4.3一般过程

4.4假设检验的非参数方法

4.4.1秩变换

4.4.2wilcoxon符号秩检验

4.4.3wilcoxon秩和检验

4.4.4关于分布无关检验方法的讨论

4.5置信水平α、统计功效1-β和p值

4.6单因素方差分析

4.6.1方差分析

4.6.2统计推断

4.6.3多重比较

4.7案例

4.7.1美国佛罗里达everglades湿地案例

4.7.2kemp的鳞龟

4.7.3水质达标评价

4.7.4红树林和海绵体之间的相互作用

4.8参考文献说明

第ⅱ部分统计建模

第5章线性模型

5.1作为线性模型的anova

5.2简单和多元线性回归模型

5.2.1最小平方法

5.2.2鱼样本中的：pcbs

5.2.3用一个预测变量来回归

5.2.4多元回归

5.2.5相互作用

5.2.6残差和模型评估

5.2.7类型预测变量

5.2.8芬兰湖泊案例和共线性

5.3构建预测性模型的一般考虑

5.4模型预测的不确定性

5.5双因素anova

5.5.1相互作用

5.6参考文献说明

第6章非线性模型

6.1非线性回归

6.1.1分段线性模型

6.1.2案例：美国丁香花初次开花的日期

6.2平滑

6.2.1散点图平滑

6.2.2拟合局部回归模型

6.3平滑和加性模型

6.3.1加性模型

6.3.2加性模型的拟合

6.3.3北美湿地数据库

6.3.4讨论：科学中非参数回归模型的作用

6.3.5时间序列的季节分解

6.4参考文献说明

第7章分类和回归树

7.1美国俄勒冈wmamette河案例

7.2统计学方法

7.2.1种植和修剪一棵回归树

7.2.2种植和修剪一棵分类树

7.2.3绘图选项

7.3讨论

7.3.1将cart用做建模工具

7.3.2离差平方和与概率假设

7.3.3cart和生态阈值

7.4参考文献说明

第8章广义线性模型

8.1逻辑斯蒂回归

8.1.1案例：评估将紫外线作为饮用水消毒剂的有效性

8.1.2统计学问题

8.1.3在r中拟合模型

8.2模型解释

8.2.1逻辑特变换

8.2.2截距

8.2.3斜率

8.2.4其他的预测变量

8.2.5相互作用

8.2.6对隐孢子虫案例的讨论

8.3诊断学

8.3.1箱式残差图

8.3.2偏大离差

8.4啮齿动物食用种子：逻辑斯蒂回归的第二个案例

8.5泊松回归模型

8.5.1中国台湾西南部的砷数据

8.5.2泊松回归

8.5.3暴露和偏移

8.5.4偏大离差

8.5.5相互作用

8.5.6泊松回归与逻辑斯蒂回归

8.5.7负二项分布

8.6广义加性模型

8.6.1案例：西南极半岛的鲸

8.7参考文献说明

第ⅲ部分高级统计建模

第9章用于模型检验和统计推断的模拟

9.1模拟

9.2用模拟来概括线性和非线性回归

9.2.1一个人门案例

9.2.2概括线性回归模型

9.2.3用于模型评估的模拟

9.3基于重采样的模拟

9.3.1自举聚合

9.3.2案例：基于cart的阈值的置信区间

9.4参考文献说明

第10章多层回归

10.1多层结构和可交换性

10.2多层anova

10.2.1食用潮间海藻的动物

10.2.2农田的n2o背景释放量

10.2.3何时使用多层模型?

10.2.4双因素anova

10.3多层线性回归

10.3.1非嵌套分组

10.3.2多元回归问题

10.4广义多层模型

10.4.1利物浦飞蛾——一个逻辑斯蒂回归案例

10.4.2美国饮用水中的隐孢子虫——一个泊松回归案例

10.4.3采用模拟手段来检验模型

10.5参考文献说明

参考文献

索引