药物设计学

第一章  药物设计的生命科学基础第一节  药物作用的生物靶点一、生物靶点的分类二、生物大分子的结构与功能第二节  药物与生物大分子靶点的相互作用一、药物与生物大分子靶点相互作用的化学本质二、药物与生物靶点相互作用的适配关系三、药物与靶点相互作用的基本理论第三节  生物膜与药物的跨膜转运一、生物膜的基本结构与功能二、生物膜的物质转运机制与调节三、影响膜转运的分子药理学第二章  基于细胞信号转导途径的药物设计第一节  细胞的信号转导一、信号与信号转导的物质基础二、化学信号分子三、细胞的信号接收系统四、细胞内信号转导系统五、第三信使六、对信号转导系统的药物干预第二节  基于调节  第二信使的药物设计一、调节  cAMP和cGMP信号通路的药物设计二、调节  钙的药物设计三、调节  激酶系统的药物设计第三节  基于调节  第三信使的药物设计一、维甲酸受体和类维甲酸受体配基的药物设计二、过氧化物酶体增殖因子激活受体配体的药物设计三、维生素D受体配体的药物设计第三章  基于生物活性肽的药物设计第一节  肽类化合物的结构与功能一、肽类化合物的结构特征二、机体中某些重要的内源性生物活性肽0第二节  类肽的设计原理与方法一、构型限制性氨基酸的设计二、肽链骨架的修饰三、二肽片段拟似物四、整体分子构象的限定五、肽二级结构的分子模拟六、基于内源性活性肽与靶点结合后的拓扑结构分子设计第三节  类肽在药物设计中的案例分析一、苯并二氮革二酮类HDM2-p53抑制剂二、β-分泌酶抑制剂三、环肽类组蛋白去乙酰化酶抑制剂第四章  基于酶促原理的药物设计第一节  酶促反应的基础知识一、酶促反应理论二、酶的激活与抑制第二节  酶抑制剂的设计原理一、酶抑制剂的发展与分类二、酶抑制剂的合理设计第三节  酶抑制剂类药物一、HIV逆转录酶抑制剂二、酪氨酸激酶抑制剂第四节  案例分析：波西匹韦的发现一、研究背景二、苗头化合物的发现三、先导化合物的确定及优化四、上市药物波西匹韦的确定第五章  基于核酸原理的药物设计第一节  核酸的生物合成一、嘌呤核苷酸的合成二、嘧啶核苷酸的合成三、核苷二磷酸、核苷三磷酸及脱氧核糖核苷酸第二节  代谢拮抗类抗肿瘤、抗病毒药物的设计一、叶酸类抗代谢物二、嘌呤类抗代谢物三、嘧啶类抗代谢物第三节  核苷类抗病毒药物的设计一、基于核苷糖环修饰的药物二、基于核苷碱基修饰的药物三、无环核苷第四节  反义核酸与小干扰RNA药物的设计一、反义核酸药物二、小干扰RNA药物第五节  表观遗传与药物设计一、DNA甲基化及其机制二、DNA甲基转移酶抑制剂的设计第六章  基于代谢原理的药物设计第一节  药物代谢与新药设计一、发现先导化合物二、优化先导化合物三、指导设计合适的剂型第二节  前药设计的基本原理一、前药的基本概念二、前药设计的目的与方法三、前药设计原理的应用四、生物前体药物第三节  软药一、软药的基本概念二、软药的设计原理及其应用第四节  靶向前药一、主动靶向前药设计及其应用二、被动靶向前药设计及其应用第七章  基于生物电子等排原理的药物设计第一节  生物电子等排体的一般概念一、生物电子等排体的提出与发展二、生物电子等排体的分类第二节  生物电子等排原理在药物设计中的应用一、经典的生物电子等排体的应用二、非经典的生物电子等排体的应用第三节  me too药物的开发一、me too药物的基本概念二、me too药物的设计策略三、me too药物的成功案例第八章  基于分子杂合原理的药物设计第一节  分子杂合原理与孪药一、分子杂合原理的概念二、孪药的分类三、孪药原理的应用第二节  多靶点药物一、多靶点药物概述二、多靶点药物的设计策略三、案例分析：培美曲塞的研发历程四、多靶点药物在各类疾病中的应用第九章  基于组合化学技术的药物设计第一节  组合化学的基本原理一、组合化学的概念二、组合化学的原理第二节  组合化学库的构建一、组合库的设计二、组合库的构建方法三、组合库合成技术四、化合物库生物活性成分结构识别五、组合库发展趋势第三节  高通量筛选技术r一、高通量筛选技术的组成二、计算机虚拟筛选三、高通量筛选发现药物的基本过程第四节  案例分析——抗疟药物靶点Plasmepsin Ⅱ抑制剂的筛选第十章  基于化学基因组学原理的药物设计第一节  化学信息学一、化学信息学的概念二、化学信息学的分子模型化技术三、化学数据的分析和化学数据库的创建四、化学信息学与新药开发第二节  生物信息学一、生物信息学的概念二、生物信息学的研究目标和任务第三节  化学基因组学与药物设计一、化学基因组学发现和确证药物及其靶标二、化学基因组学的关键技术第十一章  基于靶点结构的药物分子设计第一节  靶蛋白结构的预测一、蛋白质三维结构预测二、活性位点的分析方法第二节  分子对接与虚拟筛选一、分子对接二、计算机虚拟筛选技术三、反向分子对接第三节  全新药物设计一、全新药物设计基本概念二、全新药物设计的分类第四节  基于片段的药物分子设计一、基于片段的分子设计原理与方法二、活性片段的检测技术三、从活性片段到先导化合物的研究方法第五节    案例分析：基于靶点结构的药物设计在HIV蛋白酶先导化合物发现的应用一、研发背景二、先导化合物的发现第十二章  基于配体结构的药物设计第一节  定量构效关系一、二维定量构效关系二、三维定量构效关系三、QsAR案例分析第二节  药效团模型及其应用一、药效团元素的概念二、三维药效团的构建方法三、基于药效团的三维数据库搜索四、骨架跃迁技术的概念与应用五、案例分析第十三章  类药性及其在药物设计中的应用第一节  基本概念一、药物在体内的过程二、药代动力学及其参数三、药物毒性第二节  类药性及其评价方法和应用一、基于经验判断的类药性评价二、基于理化性质的类药性评价三、基于ADMET性质的类药性优化第三节  基于类药性的药物设计策略一、早期类药性评价二、快速、并行的成药性优化三、应用案例——索非布韦的发现第十四章  新药开发的基本途径与方法第一节  药物作用靶点的发现一、人类功能基因组学的研究二、与重大疾病相关基因的发现与表达第二节  先导化合物的发掘与结构优化一、先导化合物的发现二、先导化合物的结构优化第三节  临床候选药物的研究与开发一、临床前体内外药效学评价二、临床前安全性评价三、临床前药学研究四、药物临床研究第四节  创新药物研发实例：托法替尼的发现一、研发背景二、苗头化合物的发现三、先导化合物的确定与优化四、候选药物的确定五、托法替尼的临床研究参考文献中文索引英文索引