质谱分析实验指南
作者: 杉浦悠毅
出版社:北京大学出版社 2017年12月
简介:
本书的目的是使质谱技术能够灵活应用于生命科学,明确质谱技术能够做什么?为此,作者主要从技术和方法层面入手,图文并茂,显浅易明,通俗易懂。从仪器选择,样品制备,技术路线,到分析方法要点,进行了详细的介绍。首先,一是采用质谱分析技术"发现"未知因子,包括配体结合蛋白的发现,翻译后修饰蛋白的检出和鉴定,产生变化蛋白的发现,疾病生物标志物的发现;采用CE/MS技术发现抑郁症血液生物标志物为实例。微生物菌种的快速鉴定等。二是采用质谱分析技术"定量"已知因子,包括检测氨基酸 通过血浆游离氨基酸轮廓早期发现癌症的方法,检测酸性磷脂,检测小RNA,检测气体分子;以硫醇为探针检测H2S及其定量,检测细胞的能量代谢;低氧环境下代谢物的定量,检测细胞的氧化应急;以亲电子化合物8-nitro-cGMP定量为实例,检测蛋白质的"结构变化"等。三是采用质谱成像技术对组织/细胞"可视化",包括细胞的"能量代谢"成像,在慢性炎症组织中的磷脂分子成像,"药物动态"成像,细胞 亚细胞结构的代谢伴随着细胞动态的观察等。通过基础篇和实践篇的对应关系,完成从基础理论到实际应用的过程,也完成了对MS这个复杂高端仪器的广泛普及应用过程。
【目录】
前言 杉浦悠毅
本书的构成 5
基本篇 —原理和基础知识—
1 生命科学研究中质谱分析应用方法 杉浦悠毅 2
2 掌握MS实验的具体框架 杉浦悠毅 10
3 “发现”质谱分析 定性MS的基础和原理 杉浦悠毅,新间秀一 18
4 “测定”质谱分析 定量MS的基础和原理 杉浦悠毅,新间秀一 29
5 “成像”质谱分析 质谱成像的基础和原理 杉浦悠毅,新间秀一 37
实践篇 —以实验方法为中心—
第Ⅰ章 用质谱分析“发现”未知因子
1 发现配体结合蛋白质 加部泰明,末松 诚,半田 宏 48
2 翻译后修饰的检测与鉴定 以微管蛋白翻译后修饰新发现为例
池上浩司,新间秀 一,濑藤光利 59
3 探知表达变化的蛋白质 以新蛋白质组学的*定量为例
松本雅记,中山敬一 71
4 发现疾病生物标志物 以CE/MS发现重症抑郁障碍血液生物标志物为例
藤森玉辉,大桥由明,川村则行 81
5 迅速鉴定微生物种类 松山由美子,工藤寿治,川口寿太郎,韮泽 崇 89
第Ⅱ章 用质谱分析“测定”已知因子
6 测定氨基酸 依据PFAA表达谱的癌症早期发现方法 今泉 明,吉田宽郎 98
7 测定酸性溶血磷脂 中西广树 106
8 测定miRNA 坂口裕理子,铃木 勉 112
9 测定气体分子 使用硫醇探针对H2S进行定量 菱木贵子 120
10 测定细胞能量代谢 缺氧环境下代谢通量的定量 南嶋洋司 132
11 测定细胞氧化应激 以亲电子化合物8-nitro-cGMP的定量为例
泽 智裕,居原 秀,赤池孝章 139
12 测定蛋白质的“结构变化” 山本龙也 147
第Ⅲ章 用质谱分析“成像”
13 细胞“能量代谢”成像 杉浦悠毅,梶村真弓 157
14 慢性炎症组织中溶血磷脂成像 杉浦悠毅,花田 充,本多久乐乐 170
15 “药物代谢动力学”成像 新间秀一,滨田哲畅 180
主导方案 选择*重要的实验步骤进行说明
·用Nano LC/ESI-MS系统进行MS测定、数据库检索的详细步骤 解说:山本龙也
·用双向电泳进行蛋白质分离、凝胶内消化的详细步骤 解说:新间秀一
· 采用三重四级杆LC/MS/MS系统MRM法分子定量的详细步骤 解说:中西 豪
·质谱成像中组织切片样品制备、MS测定的详细步骤 解说:杉浦悠毅
第IV章 质谱分析研究策略
16 向着代谢系统生物学的新理解迈进
末松 诚,大村光代,森川隆之,笠原正贵,久保亚紀子,南嶋洋司,梶村真弓 191
结束寄语——写给即将踏上质谱分析之旅的各位朋友 末松 诚 203
附录
1.为初学者准备的质谱分析专业用语集 206
2.适合各实验目的的质谱仪种类简介 208
索引 212
专栏 —前沿应用介绍— 杉浦悠毅
·领域改变,质量也会发生变化 46
·不同领域装置的融合 用质谱流式细胞仪进行多重抗体标记和细胞分析 97
·金属元素分布的质谱成像 189